Дарья Алешкина работает в качестве постдокторанта при Еврейском университете Иерусалима. В лаборатории профессора Йеху Морана она исследует, каким образом морские актинии справляются с вирусными инфекциями. При этом ключевым является то, что она внедрила новые подходы к исследованиям, которых ранее здесь не применялось, и уже добилась значительных успехов, подтвержденных публикацией в журнале Nature Ecology & Evolution. В беседе Дарья рассказывает о том, как её опыт работы с генетикой человека перешел на изучение иммунитета беспозвоночных, что позволило ей разработать уникальные инструменты для анализа древних защитных механизмов.

Как начался ваш профессиональный путь и привели ли какие-то факторы к тому, что вы оказались в Иерусалиме, занимаясь изучением защиты от болезней у морских актиний?

Моя научная деятельность началась с работы над генетикой человека в стенах Санкт-Петербургского государственного университета. В процессе обучения на магистратуре я переключилась на кариологию морских моллюсков, а затем получила дополнительное образование в области биоинформатики. В 2018 году для защиты диссертации я отправилась в Прагу и поступила в Карлов университет, где мои исследования были сосредоточены на биологии развития и клеточной биологии – конкретно, изучении некодирующих РНК в яйцеклетках млекопитающих и у эмбрионов.

В 2022 году я успешно защитила диссертацию, получив степень PhD. После этого год поработала научным сотрудником при Чешской академии наук. В 2023 году переехала в Иерусалим для решения другой задачи: выяснить, как живые существа на элементарном уровне противодействуют вирусам и какие РНК-связанные процессы участвуют в защите от них. На протяжении всего пути я меняла объекты исследования и местоположение, но сохраняла общий научный интерес – понять, каким образом клетка организует свои молекулярные механизмы для выполнения важнейших задач: деления клеток, развития организма и защиты.

Многие исследователи используют актиний Nematostella vectensisКак этот вид был выбран для использования как удобный объект исследования? В чем заключался ваш уникальный вклад при изучении этого организма, и какое влияние это оказало на наши представления о защите от вирусов?

Nematostella vectensisЭтот организм – ценная модель, однако ее эффективность зависит от подхода. Моя работа заключается не только в наблюдении за иммунитетом, но и во внедрении методики микроинъекций, благодаря которой теперь любой лаборант способен проводить эти манипуляции самостоятельно, а не только я лично. Это значительно ускорило темпы работы всей исследовательской группы. Именно на этой модели мы впервые продемонстрировали тесную взаимосвязь двух древних белков иммунной системы; статья об этом была опубликована в Nature Ecology & Evolution в 2026 году. Для меня NematostellaЭто не просто изучаемый объект, это мощный инструмент, которым я научилась владеть с невиданной ранее точностью для нашей лаборатории.

Присоединившись к команде Йеху Морана, вы перенесли проверенные методики из предыдущих исследований. Какие конкретно навыки и техники были внедрены в изучение Nematostella vectensis?

Прежде чем я присоединился к исследовательской группе, в лаборатории не применялись технологии обработки полилактида. Внедрение этих методов открыло возможность для анализа клеточных реакций эмбрионов, Nematostella vectensisи стало основой для научных публикаций коллектива. Nature. В частности, применение PLA к планулам N. vectensisБлагодаря этому подходу удалось установить тесную взаимосвязь по расположению двух важных иммунных белков, относящихся к древним периодам. Данные представлены в работе опубликованы в Nature Ecology & Evolution(Sharoni et al., 2026). Помимо этого, я провожу микроинъекции препаратов внутрь эмбрионов. NematostellaЯ передаю свой опыт коллегам и помогаю им освоить эту технику. Убеждена, что ее реальная значимость раскрывается тогда, когда ею начинают пользоваться другие ученые.

Не могли бы вы вкратце рассказать о том, какие результаты демонстрируют методики RNA-PLA и RNA-puro-PLA, чем они отличаются от общепринятых способов анализа, и почему для вас принципиально важно, чтобы эти подходы были восповторяемыми и применялись другими научными коллективами?

Технологии RNA-PLA и RNA-puro-PLA позволяют выявить аспекты клеточной организации, которые остаются незамеченными при использовании обычных методов: непосредственную связь между молекулой РНК и белком внутри клетки, а также отдельные этапы синтеза белка на основе мРНК. В отличие от анализа полисомных комплексов, они не дают усредненного результата по всей популяции клеток; в то же время, если сравнивать их с обычной флуоресцентной гибридизацией in situ (smFISH), они отображают не только расположение РНК, но и сам процесс ее трансляции.

Я создала и модифицировала оба метода во время выполнения диссертации. В настоящее время ими пользуются другие исследовательские группы для решения различных задач: например, для изучения взаимодействия между белками и молекулами РНК в клетках, включая вирусные РНК при инфекции EBV B-лимфоцитов, а также для исследования локального синтеза определенных мРНК. Для меня крайне важно, чтобы эти методы были надежными и давали одинаковые результаты не только у нас в лаборатории, но и в других исследовательских центрах.

Вы выступили как основной или соавтор в двенадцати публикациях, включая Nature Communications, Nucleic Acids Research и Nature Ecology & Evolution. Что объединяет эти работы?

Мой исследовательский опыт включает три различные сферы: изучение РНК, процессы раннего развития и иммунные механизмы у беспозвоночных. Для меня это не просто количественный показатель, а свидетельство моей способности проводить исследования на пересечении различных научных областей. И когда в 2026 году я получил приглашение для оценки статей Nature Reviews Immunology и The ISME Journal, это стало признанием того, что мои знания ценятся не только внутри конкретной области специализации, но и сразу по нескольким направлениям.

Ваши научные достижения также получили поддержку от фондов финансирования и были отмечены авторитетными изданиями. Пожалуйста, поделитесь более подробной информацией об этом.

Я руководила выполнением двух исследовательских проектов, финансируемых грантами – одним от GA UK в Карловом университете и другим от IGA при Институте физиологии и генетики животных Чешской академии наук. Благодаря этим средствам я получила возможность проводить научные изыскания и набраться опыта самостоятельного управления проектами, а также разработки подходов к экспериментальной работе. С 2024 года я получаю поддержку от фонда Lady Davis Trust. В том же году мне предложили оценивать научные публикации для , The ISME Journal и Nature Reviews Immunologyжурнала.» Я выступала с результатами исследований на Cnidofest 2024, прошедшем в США, и на конференции Израильского общества эволюционной биологии также в 2024 году, а еще – на симпозиуме в Лиссабоне в 2019. Помимо этого, я представляла свои работы в виде постеров на конференции EMBO в 2025 году и в Институте Вейцмана в 2023.

Опыт работы в нескольких государствах и использование различных модельных организмов – это было связано с возникшими сложностями или представляло собой заранее спланированную стратегию?

Переезды для меня были связаны не столько со сменой страны проживания, сколько с решением новых научных задач. Работа в Санкт-Петербурге позволила мне освоить цитогенетику и кариологию, однако я осознала стремление видеть происходящие внутриклеточные процессы, а не только хромосомы. В Праге мой интерес переключился на молекулярную биологию, где были разработаны новые методики – RNA-PLA и Puro-PLA. Переезд в Иерусалим вернул меня к изучению морских организмов, но уже с использованием этих инструментов, что дало возможность ставить вопросы, которые ранее не могли быть решены технически. Каждый этап развития был направлен на то, чтобы я могла не только фиксировать наблюдения, но и активно влиять на процессы, выявляя их причины.

В контексте идеи перепрограммирования иммунной системы: какие перспективы дальнейшего исследования вам представляются и какое значение это может иметь за пределами лабораторных условий?

В настоящий момент я стремлюсь к созданию самостоятельной исследовательской программы и публикации значимых результатов, касающихся защиты от вирусов у кишечнополостных. В перспективе планирую подавать заявки на финансирование для начинающих ученых и формировать собственную научную лабораторию, которая будет сочетать изучение биологии РНК с исследованиями эволюции иммунной системы против вирусных инфекций. Изучение принципов работы более простых систем защиты организма служит фундаментом для проведения экспериментов, направленных на модификацию отдельных элементов. Это открывает возможность перехода от простого перечисления фактов к определению взаимосвязей между событиями внутри клеток. Подобные базовые научные исследования являются основой для будущих практических применений.