По словам медиков, работающих в больницах Хьюстона, города, являющегося четвертым по численности населения в США, они выявили отличия в проявлениях болезни у пациентов, инфицированных штаммом «омикрон», и у тех, кто переболел вариантами «дельта» и «британский» SARS-CoV-2.
В первом американском рецензируемом исследовании, проведенном в Хьюстонской методистской больнице, ученые выявили особенности пациентов, зараженных омикрон-штаммом коронавируса, в сравнении с теми, кто перенес «дельту» или «альфа»-вариант. Результаты опубликован в The American Journal of Pathology.
В конце февраля 2020 года, когда началась пандемия Covid-19, сеть медицинских учреждений The Methodist Hospital System в Хьюстоне, штат Техас, начала масштабный проект популяционной геномики. Он был направлен на секвенирование всех образцов SARS-CoV-2, полученных от пациентов, проходивших лечение в местных больницах. Задача заключалась в детальном отслеживании распространения эпидемии в Хьюстоне, городе с населением около 7,2 миллиона человек. Это четвертый по величине город в Соединенных Штатах Америки и самый разнообразный с точки зрения этнического состава мегаполис в стране. На текущий момент в базе данных хранятся образцы более 70 тысяч человек.
После пиков заболеваемости, спровоцированных альфа- и дельта-вариантами, власти полагали, что эпидемия идет на спад. Тем не менее, в конце 2021 года «омикрон» быстро распространился по всему миру. С 27 ноября по 5 января в хьюстонской The Methodist Hospital System — к примеру, в больницах, центрах неотложной помощи и других медучреждениях, предоставляющих лабораторные услуги — зарегистрировали 4468 человек с симптоматическим коронавирусным заболеванием, вызванным новым вариантом патогена. К концу исследования «омикрон» стал причиной 90% новых случаев Covid-19.
В целях сопоставления данных, в выборку были также добавлены сведения о местных пациентах, перенесших ранее лечение от альфа- и дельта-вариантов коронавируса. Таким образом, в исследовании было проанализировано 40 991 случай. Первый случай заражения «новый вариант вируса, «омикрон», был обнаружен в конце ноября 2021 года, когда наиболее распространенным был «дельта», в этот же период в регионе зафиксировали стабильное уменьшение количества заболевших Covid-19. Тем не менее, к 23 декабря результаты секвенирования генома продемонстрировали, что доля «более 90% новых случаев заболевания вызваны вариантом «омикрон.
«Согласно расчетам, период удвоения числа случаев заражения за три недели составил около 1,8 дня, что свидетельствует о том, что скорость распространения омикрон-штамма была примерно в три раза выше, чем у дельта-варианта», – отмечают авторы исследования. При этом большая часть инфицированных оставалась на территории США: соответственно, они заразились «омикроном» внутри страны.
Пациенты, инфицированные омикрон-штаммом, в среднем оказались значительно моложе, чем те, кто перенес альфа- или дельта-варианты SARS-CoV-2. Средний возраст заболевших омикроном составил 44,3 года, при этом 57,8% из них были женщинами «омикроном») сталкивались с меньшей потребностью в стационарном лечении, и в случае обращения за медицинской помощью в больницу, сроки пребывания там были значительно сокращены: 3,2 дня вместо 5,1 дня в случае «альфы» и 5,4 дня для «дельты».
За рассматриваемый период 38 пациентов скончались от омикрон-штамма, что означает, что выздоровели 99,1% (в то время как среди пациентов с британским штаммом зафиксировано 170 смертей и выжило 94,6%, а с «дельтой» (выжили 94,7%)). Всего одному пациенту с «у 49 пациентов потребовалась искусственная вентиляция легких, а у других – экстракорпоральная мембранная оксигенация (инвазивный способ обогащения крови кислородом.
Невакцированных пациентов оказалось 11 415, что составило 79,4%. При этом, среди заболевших омикрон-штаммом доля привитых была выше: вакцинацию не проходили только 1815 человек (40,6 «дельтой» (72,6%). Что касается так называемого британского варианта, то полный курс вакцинации к моменту заболевания получили только 101 человек (3,2%). В общей сложности 156 человек (3,5%) заболели «омикроном» как минимум через неделю после первой вакцинации, 1786 человек (40%) получили результаты через 14 дней после второй, а 711 человек (15,9%) – не ранее, чем через две недели после ревакцинации. Для сравнения, при анализе дельта-штамма было выявлено: 494 (3,1%), 3679 (23,4%) и 140 (0,9%) человек соответственно.
В ходе проверки всех полных геномных последовательностей, хранящихся в их базе данных, ученые выявили у двух человек субвариант омикрон-штамма — Подвариант BA.2, известный как «Стелс-омикрон», пока что только набирает обороты в глобальном масштабе, хотя в ряде государств, например, в Дании, уже стал наиболее распространенным.