Исследователи из Дании и Великобритании провели секвенирование ДНК вымерших медведей, извлеченной из почвы, и назвали свою работу значительным достижением в области восстановления древних геномов.
Исследование опубликовано в журнале Current Biology. Извлечение древней ДНК из почвы ознаменовало собой значительный прорыв в биологии, предоставив возможность определять, какие виды существовали в прошлом, не по ископаемым останкам, а по следам их жизнедеятельности, сохранившимся в почве.
В этих образцах почвы присутствуют редкие и разрозненные остатки живых существ, не говоря уже о том, что зачастую это следы сразу нескольких особей близкородственных видов. Поэтому секвенировать полноценный геном из такого рода остатков непросто.
Авторы исследования, ученые из Центра геогенетики Фонда Лундбек при Копенгагенском университете (Дания) и Кембриджского университета (Великобритания), утверждают, что ранее оно касалось исключительно органеллярных геномов. «Анализ древней ДНК был ограниченным», — отметил первый автор работы, профессор Миккель Винтер Педерсен.
— Фрагментированная ДНК, извлеченная из образца почвы, позволяла определить, обитал ли конкретный вид в определенной местности и в какой период времени, однако не предоставляла информации о его характеристиках. По мнению генетиков, новое исследование открывает возможности для более детального анализа древней ДНК.
Этот процесс был продемонстрирован на примере извлечения таких образцов из почвы пещеры Чикиуит в Мексике. Анализируемые образцы содержали фекалии и мочу вымерших медведей — Arctodus simus, который населял территорию современной Мексики примерно 11-12 тысяч лет назад и являлся предком современного американского черного медведя, Ursus americanus.
В испражнениях живых организмов содержатся фрагменты ДНК, которые ученым удалось извлечь с помощью передовых методов секвенирования. Полученную ДНК сравнили с геномами других медведей, включая 83 современных вида и три вымерших около 22 тысячи лет назад).
Благодаря этому исследованию ученые получат возможность узнать больше о данных животных, в частности, какое положение они занимали в эволюционном дереве, как осуществлялись их миграции и насколько их генеалогическая линия отличалась от общей предков. По мнению специалистов из Дании и Великобритании, новый метод позволяет получать аналогичные сведения и о других видах, анализируя почву с их экскрементами.