Предположение возникло по случаю 36-летней женщины из Южной Африки. Инфицированная как ВИЧ, так и SARS-CoV-2, её случай показал многочисленные мутации коронавируса. После этого биоинформатик из Южной Африки задался вопросом о происхождении варианта Омикрон, который сейчас есть в 23 странах.
Пока это лишь гипотеза, но возможно, люди с крайне слабым иммунитетом, не способные его устранить, будут страдать от долгой инфекции. SARS-CoV-2Источник появления новых вариантов — носители вируса с ослабленной иммунной системой. Гипотеза заключается в том, что их иммунитет оказывает «длительное иммунное давление», которое создает условия для генетических мутаций. Другими словами, иммунный ответ не уничтожает коронавирус полностью, но подталкивает его к эволюции, оказывая избирательное давление.
Тулио де Оливейра, биоинформатик из Южной Африки, особенно интересуется появлением вариантов у людей в странах Африки к югу от Сахары с нераспознанным или плохо леченным ВИЧ — около 8 миллионов человек. Преимущественно молодые, невакцинированные и имеющие ослабленную иммунную систему.
Профессор де Оливейра со своей командой изучил несколько клинических случаев для анализа эволюции коронавируса у пациентов с ВИЧ. В июне внимание привлек один ВИЧ-положительный пациент из ЮАР, получавший антиретровирусные препараты и болевший SARS-CoV-2. Врачи наблюдали за развитием вируса в его организме в течение 233 дней (более 7 месяцев). (пока еще не опубликованные) удивительны.
Всего обнаружено 13 различных мутаций коронавируса.
Лечение пациента от коронавируса длилось шесть месяцев. В этот период медики выявили возникновение нескольких мутаций вируса. Первой оказалась E484K, замеченная на шестой день после постановки диагноза. Из-за этой мутации снижалась активность нейтрализующих антител. Через месяц обнаружили вторую мутацию, а затем еще и еще… Всего в вирусе возникло 13 уникальных мутаций.
Пациент страдал сильной иммуносупрессией. Начальное количество Т-клеток было крайне низким — всего 6 клеток на мкл крови. Через шесть месяцев, с ростом числа лимфоцитов, организм избавился от коронавируса и снизил репликацию ВИЧ.
Случай единичный, и выводы делать преждевременно. Но дальнейший анализ образцов крови пациента обнаружил тридцать мутаций ДНК, некоторые из которых потенциально влияют на реакцию организма на вакцину или терапию.
Подверженная ослаблению иммунная система создает благоприятную среду для возникновения мутаций.
В чем же различие от здоровой иммунной системы? Система защитного механизма человека с ослабленным иммунитетом уже не может противостоять патогенам – бактериям, вирусам, паразитам и токсичным веществам – так же эффективно, как раньше.
«При высокой иммунной подавленности вирус способен находиться в организме человека продолжительное время. Чем больше копий вируса создаётся, тем больше у него возможностей для мутаций и обхода оставшихся сил иммунной системы. — заявил в своем обращении доктор Брюс Уокер, специалист по иммунологии и руководитель Института Рагона в Кембридже. Вместе с тем он указывает на возможность возникновения дискриминации по отношению к таким пациентам.
Специалист по инфекционным заболеваниям из Гарварда доктор Джонатан Ли был одним из первых, кто выявил значительные мутации коронавируса у пациента с ослабленным иммунитетом. При сильно ослабленной иммунной системе Т-клетки у таких пациентов, пораженные ВИЧ, не обеспечивают жизненно важную поддержку, необходимую В-клеткам иммунной системы для очистки организма от коронавирусной инфекции.
Профессор Де Оливейра опасается, что подобный сценарий породил вариант Омикрон. До июньского исследования вирусологи не считали, что у ВИЧ-положительных людей результаты будут хуже, чем у других людей с ослабленным иммунитетом. Результаты исследования могут помочь контролировать эпидемию ВИЧ и появление вариантов. Де Оливейра не исключает других объяснений, так как вариант имеет большое количество мутаций. Возможно, что Омикрон уже несколько месяцев циркулирует в других местах, постоянно накапливая генетические изменения.