Изучив взаимодействие фекального трансплантата, применяемого для лечения заболеваний кишечника, европейские ученые установили, как он влияет на изначально присутствовавшие в нем микроорганизмы.
Фекальная трансплантация, или трансплантация фекальной микробиоты — это относительно новая и многообещающая методика лечения, демонстрирующая значительную эффективность при ряде бактериальных инфекций и воспалительных заболеваниях кишечника. Существуют также данные, указывающие на потенциальную пользу фекальной трансплантации при лечении других заболеваний, включая депрессию и аутизма.
В процессе применяют материал, получаемый от здоровых доноров, прошедших тщательный отбор. В него входят не только бактерии, но и другие микроорганизмы, а также бактериофаги (вирусы, поражающие бактерии), находящиеся в их естественной среде – содержимом кишечника. Помимо трансплантата, в организм пациента вводят соединения, регулирующие рост микрофлоры, посредством которых микроорганизмы осуществляют взаимодействие».
Процедура выполняется с использованием зондов, вводимых через рот или анус, либо с применением капсул, содержащих высушенный препарат.
Хотя фекальная трансплантация обладает значительным потенциалом, ее принципы действия до сих пор недостаточно изучены. В связи с этим, группа ученых из Нидерландов и Германии провела новое статью в Nature Medicine очень важному вопросу: как происходит взаимодействие пересаживаемых микробов с теми, что обитали в кишечнике исходно? Ответив на него, мы сможем лучше понять, как работает фекальная трансплантация, и сделать ее более эффективной и безопасной.
Существует распространенное мнение о том, что ключевым фактором успешной трансплантации микробиоты является качество донорского материала. Новое исследование ставит это под сомнение. Работа основана на данных о состоянии микробиоты более 300 пациентов — как до фекальной трансплантации, так и после. В общей сложности авторы отметили в них свыше тысячи разных микроорганизмов.
Исследователи использовали анализ метагеномов и машинное обучение, чтобы выявить те факторы, которые особенно важны для успешности терапии. Это могло быть и наличие или отсутствие конкретных групп микробов. В результате оказалось, что наибольшее значение имеет именно разнообразие микробиома реципиента, а также то, насколько он отличается от донорского.
Авторы ранее уже демонстрировали, что после фекальной трансплантации микробы «люди, принадлежащие к двум разным группам, могут успешно сосуществовать.
При проведении новой работы был применен экологический подход, подразумевающий исследование популяций микроорганизмов и их взаимодействий, что представляется целесообразным для уникальных методов лечения, таких как фекальная трансплантация.