Американские ученые изучили одну из разновидностей вируса SARS-CoV-2, которая распространяется в США и встречается и в других государствах. В ходе исследования были выявлены три основные характеристики этого штамма, благодаря которым он способен уменьшать эффективность антител у людей, ранее перенесших COVID-19 или получивших мРНК-вакцинацию, например, препаратами Pfizer и BioNTech или Moderna, в 2-3,5 раза.
Изучением родственных штаммов вируса SARS-CoV-2 B.1.427 и B.1.429 (командой из лаборатории Дэвида Вислера велось исследование штамма «эпсилон», классифицированного Всемирной организацией здравоохранения ( David Veesler’s lab) Департамента биохимии Университета штата Вашингтон в Сиэтле. За последние годы эта группа исследователей, совместно с международными партнерами, проводила детальный анализ характеристик возбудителей атипичной пневмонии ( SARS). В связи с этим, у лаборатории имеется значительный опыт выявления ключевых модификаций в данных вирусах.
В научной статье ученые представили сведения о результатах исследований, проведенных с «эпсилон-штаммом» коронавируса опубликована на прошлой неделе в журнале Science Американська асоціація сприяння розвитку науки ( AAAS).
Согласно заключению американских вирусологов, ключевым моментом является то, что данный вариант SARS-CoV-2 использует «непрямую и необычную стратегию избегания нейтрализации антителами». Для начала ученые оценили эффективность моноклональных антител в плазме переболевших Covid-19 и вакцинированных против «эпсилон-штамма». Она оказалась в 2-3,5 раза ниже, чем против «изначального» варианта коронавируса, впервые зафиксированного в китайском Ухане. Чтобы понять, как «эпсилон» добивается таких результатов, пришлось буквально рассмотреть его со всех сторон — изучить вирионы при помощи криоэлектронной микроскопии и секвенировать их геном.
Ученые выявили три ключевые мутации в «эпсилон-штамме». Первая из них вызвала изменения в расположении белков на участке вириона, отвечающем за связывание с рецепторами («шип»). В результате 14 из 34 моноклональных антител, предназначенных для взаимодействия с этой областью вируса, утратили способность к ней. Две другие генетические отличия от других штаммов привели к изменениям в структуре амино-конца ( N-terminal domain, такое изменение строения вириона позволяет ему избегать все 10 специфических антител, поскольку мутация затрагивает аминогруппу, являющуюся началом молекулы гликопротеина, формирующего другую часть «шипа» коронавируса.
Согласно методу молекулярных часов, появление предка «эпсилон-штамма» зафиксировано на конец весны 2020 года. Время его фактического возникновения установить не удалось, однако летом прошлого года он приобрел признаки отдельной разновидности B.1.427 и B.1.429. В настоящее время этот подвид SARS-CoV-2 получил широкое распространение в Северной Америке и встречается уже, как минимум в 34 странах.
Насколько это опасно
Хотя существуют действенные методы обхода иммунной системы, «эпсилон-штамм» не является самым опасным фактором в ходе пандемии Covid-19. Но по заразности B.1.427 и B.1.429 лишь незначительно превосходит «уханьский» штамм — согласно данным Центров по контролю и профилактике заболеваний США ( CDC) всего на 20%.
В заключение, снижение активности плазмы крови в 2-3 раза у переболевших и вакцинированных людей по отношению к вирусу еще не является критичным. К счастью, при обнаружении инфекции иммунная система человека способна быстро увеличивать выработку антител. Это позволяет избежать развития симптомов заболевания и нейтрализовать возбудителя, даже если активность снизилась в 7-9 раз. Однако при снижении активности более чем на порядок возникают сложности. Также стоит учитывать, что реакция организма на инфекцию индивидуальна, и количество вырабатываемых антител может отличаться, поэтому любое снижение активности плазмы более чем в пять раз требует внимания.
Именно по этому параметру SARS-CoV-2 линии B.1.617 («каппа» и «дельта» представляют наибольшую угрозу. Этот вариант коронавируса оказался в 2-3 раза более заразным по сравнению с другими распространенными вариантами. Кроме того, активность сыворотки крови вакцинированных людей против этого штамма снизилась в 4,3-5,1 раза. При этом, исследователи, выявившие этот факт, изучали плазму как людей, вакцинированных мРНК-вакцинами, как это сделали сотрудники лаборатории Дэвида Вислера, так и получивших препараты на основе вирусных векторов ( Oxford/AstraZeneca). Последние во многих случаях оказываются более эффективными, однако не всегда способны гарантировать полную защиту от «дельта-штамма». То есть, даже у людей, вакцинированных препаратом «Спутник», существует вероятность заражения «индийским» коронавирусом V», вакцинация поможет избежать тяжелого течения болезни и предотвратить серьезные осложнения.