Изучив данные, полученные от почти трех миллионов пациентов из ЮАР, которым был диагностирован SARS-CoV-2, исследователи установили, что омикрон-вариант значительно снижает эффективность иммунитета, приобретенного после перенесенной инфекции, и стал причиной увеличения числа повторных заражений Covid-19. По сравнению с бета-вариантом и вариантом «дельта», который долгое время был наиболее распространенным в мире, омикрон демонстрирует более высокую способность уклоняться от иммунного ответа».
Специалисты из Национального института инфекционных заболеваний Южной Африки, а также из Стеленбосского, Йоханнесбургского (Университет Витватерсранда) и Квазулу-Натал, провели исследования и установили, что недавно выявленный омикрон-штамм коронавируса в несколько раз повышает риск повторного заражения — по сравнению с «бетой» ( африканский вариант) и «дельтой» (индийский). Предварительный отчет опубликовали вчера на портале medRxiv.org: это указывает на то, что работа ещё не подвергалась экспертной оценке, поскольку была выполнена в ускоренном режиме.
Новый вариант вируса — линия B.1.1.529 — был выявлен в конце ноября в густонаселенной провинции Гаутенг (ЮАР) по результатам анализа проб, собранных в начале месяца. Как утверждают авторы исследования, предварительные данные показывают базовое репродуктивное число для Гаутенга составило 2,3. Омикрон-вариант имеет от 26 до 32 (по другим данным, в S-белке выявлено свыше 40 мутаций, значительная часть которых находится в области, отвечающей за связывание с рецептором (RBD). Кроме того, спайковый белок содержит три делеции, одну вставку и изменения в других его участках. По словам ученых, многие из этих мутаций уже известны или, по предварительным данным, способствуют «уклонению» от нейтрализующих антител. Исследования вызывавших ранее опасения вариантов продемонстрировали, что они могут существенно отличаться с точки зрения антигенных свойств.
Задача заключалась в том, чтобы выяснить, как появление штаммов «бета», «дельта» и «омикрон» повлияло на вероятность повторного заражения Covid-19 в Южно-Африканской Республике. Для исследования были проанализированы данные о людях, у которых была лабораторно подтверждена коронавирусная инфекция, собранные Национальной системой эпиднадзора в период с 4 марта 2020 года по 27 ноября 2021 года. В выборку вошли результаты тестов 2 796 982 человек, при этом положительные результаты должны были быть получены с интервалом не менее 90 дней. Из почти трех миллионов обследованных у 35 670 возникли подозрения на повторное инфицирование Covid-19, у 332 – на заражение в третий раз, а у одного человека – в четвертый. Средний интервал времени от первой болезни до повторного заражения составил 180–360 дней, что было связано с волнами эпидемии в ЮАР.
«Первый пик (180 дней) включает людей, которые впервые заразились в период первой волны, а затем повторно — во время второй. Или же изначально заболели во время второй волны, а затем повторно — в третью. Второй пик (360 дней) — это люди, которые впервые переболели в первую волну, а повторно — в третью. Более поздние случаи повторного заражения (после 31 октября 2021 года) характеризуются несколько иным распределением, причем чаще всего заново заражались пациенты, которые изначально переболели во время третьей волны. Но также начиная с середины ноября повторный Covid-19 диагностируют и у людей, чье первое заражение произошло в период первой и второй волн», — сообщают авторы отчета. Что касается людей, переболевших трижды, то из них 47 человек (14,2%) в очередной раз заразились именно в минувшем ноябре. Исследователи отмечают, что это позволяет предположить связь с омикрон-штаммом.
Анализ повторных случаев Covid-19, выявленных в ЮАР до конца третьей волны (сентябрь 2021 года, когда преобладал дельта-штамм), показывает отсутствие повышенного риска повторного заражения, связанного с вариантами «дельта» или «бета». Кроме того, вероятность повторных инфекций по сравнению с первичными уменьшалась с каждой новой волной Covid-19. Ученые констатировали: «На популяционном уровне мы не обнаружили данных, подтверждающих способность вариантов «бета» и «дельта» преодолевать антитела. Однако в последнее время наблюдается резкий рост числа ежедневных повторных случаев заболевания, который значительно превышает все ожидания. Время наступления этих изменений убедительно указывает на появление варианта «омикрон.
По сравнению с первой волной COVID-19 в ЮАР (март-сентябрь 2020 года, с пиком в июле), вероятность повторного заражения во вторую волну (январь-февраль 2021 года, когда доминировал бета-вариант) составила 0,75. Для третьей волны, в сравнении с первой, этот показатель уменьшился до 0,71. Хотя вероятность заразиться «дельтой» или «бетой» в первый раз была высокой. В случае же «омикрона» расчетный риск — в сравнении с весной-летом 2020 года — достиг 2,39.
Остается неясным, может ли новая модификация вируса уклоняться от иммунитета людей, перенесших вакцинацию, и ослабляет ли она эффективность вакцин в предотвращении тяжелого течения Covid-19 и смертности. Согласно данным Всемирной организации здравоохранения, случаев смерти, связанных с омикрон-штаммом, на текущий момент не выявлено. Однако за прошедшую неделю значительно увеличился перечень стран, где зафиксированы случаи заражения. Если изначально все зарегистрированные случаи были занесены из Африки, то теперь данный вариант SARS-CoV-2 начал распространяться и на территории некоторых государств, включая Австралию, США и Великобританию.