В результате проведенного масштабного исследования, объединившего усилия тысяч экспертов из десяти стран, ученые представили предварительные данные о взаимосвязи генома и Covid-19.
В течение пандемии Covid-19 ученых волнует вопрос: почему одни заразившиеся не проявляют никаких симптомов и переносят инфекцию практически бессимптомно, а другим необходима неотложная медицинская помощь, вплоть до интенсивной терапии и искусственной вентиляции легких? Специалисты выдвинули ряд гипотез, определив множество факторов, ответственных за тяжелое течение болезни, среди которых — принадлежность к мужскому полу, наличие хронических заболеваний, лишний вес, возрастные изменения и сопутствующие факторы. Теперь это нашло свое подтверждение давние догадки: за уязвимость к SARS-CoV-2 отвечают еще и гены.
Ученые из Института молекулярной медицины Финляндии, входящего в состав Хельсинкского университета, а также специалисты Массачусетского технологического института и Гарварда обнародовали предварительные результаты масштабного исследования, которое было начато весной прошлого года Covid-19 Host Genomics Initiative, посвященного изучению генома человека в условиях пандемии коронавируса и объединившего более трех тысяч экспертов из 25 стран. Первоначальные результаты опубликованы в журнале Nature.
Исследователи изучили генетический материал, полученный от 49 562 человек, перенесших Covid-19, и двух миллионов здоровых людей. Данные были собраны из различных биобанков, клинических исследований и генетических компаний, включая 23andMe. Задача заключалась в выявлении участков ДНК, которые связаны с развитием тяжелого течения коронавирусной инфекции.
В результате проведенного анализа было установлено 13 локусов — участков ДНК, где расположены определенные гены — имеющих существенное значение для всего генома и связанных с инфекцией или тяжелым течением COVID-19. Некоторые из этих участков соответствуют заболеваниям легких или аутоиммунным и воспалительным процессам, для которых ранее была установлена связь с Covid-19. Два из 13 локусов встречались чаще у пациентов восточноазиатского или южноазиатского происхождения по сравнению с европейским населением.
Ученые отмечают, что локус гена FOXP4, отличающийся вариациями, связан как с раком легких, так и с тяжелым течением Covid-19. Поэтому его подавление может стать частью терапевтического подхода. Также, варианты генов ABO, SLC6A20, TYK2 и DPP9 демонстрируют корреляцию с течением инфекции. По словам исследователей, другие гены расположены на локусах, которые пока не подвергались изучению, на третьей и других хромосомах, их функция остается невыясненной.
Не каждый определенный участок генома отвечал за восприимчивость к коронавирусу. Поэтому для того, чтобы понять, как именно вирус взаимодействует с ДНК человека, потребуется время. Авторы проекта планируют обновлять результаты по мере поступления новых данных, а в конечном итоге Covid-19 Host Genomics Initiative должно помочь определить цели для будущих методов лечения и продемонстрировать силу генетических исследований в изучении инфекционных заболеваний.