Швейцарские ученые предлагают использовать пептиды вместо антител, чтобы обнаружить и измерить маркеры таких заболеваний, как язвенный колит и болезнь Крона, сообщает Федеральная политехническая школа Лозанны. Пептиды можно получить химическим путем, они дешевле в производстве, чем антитела, и дольше остаются стабильными, говорится в статье, опубликованной в журнале Nature Communications.
Общие воспалительные заболевания, такие как язвенный колит и болезнь Крона, можно диагностировать, измерив количество белка кальпротектина в образцах стула. А уровни кальпротектина в сыворотке можно использовать для мониторинга состояния воспаления при ревматоидном артрите. Концентрации кальпротектина в образцах обычно определяют с использованием антител, которые связываются с белком и обнаруживают его.
Но у этого метода есть один большой минус. Результаты могут различаться в зависимости от типа антител и используемого анализа. Это происходит из-за того, что антитела могут связываться с разными участками белка или иметь неоднородный состав. Антитела также могут со временем стать инактивированными, «нерабочими».
В этой работе ученые решили заменить антитела на синтетические пептиды. Пептиды представляют собой последовательности до 50 аминокислот, которые могут связываться с белками с высокой аффинностью, но, в отличие от антител, они могут быть получены химическим путем – без лишних примесей. Кроме того, пептиды стабильны, дешевле в производстве, чем антитела, и имеют более низкую изменчивость между партиями. Пептид связывается не только с большим участком поверхности кальпротектина (показано на изображении), но также и со специфической формой этого белка.
Из библиотеки, содержащей более 500 миллиардов различных пептидов, ученые выделили несколько подходящих. Итоговый пептид, как показали простые тесты, смог определить уровень белка.
[Иллюстрация: CHRISTIAN HEINIS (EPFL)/JOËLLE JOURDAN (BÜHLMANN AG)]