Ученые Университета штата Северная Каролина использовали текстовый анализ исторических и современных данных, чтобы получить больше информации о влиянии и распространении патогена растений, известного сейчас как Phytophthora infestans (фитофтороз), который вызвал картофельный голод в Ирландии в 1840-х годах и продолжает беспокоить селекционеров картофеля и томатов, сообщается на сайте университета.
Авторы исследования изучили ключевые слова «картофельная гниль», «картофельная болезнь», оцифровав исторические отчеты о фермерских хозяйствах, новостные сообщения и сельскохозяйственные отчеты Патентного бюро США с 1843 по 1845 год, чтобы показать, как патоген сначала распространился по северо-востоку США, а затем вызвал опустошительный голод в Ирландии в 1845 году. В исследовании также использовался анализ текстов в социальных сетях о современном распространении фитофтороза.
По словам ученых, текстовый анализ может стать полезным инструментом, который поможет отслеживать и визуализировать как исторические, так и современные болезни растений.
«Мы обратились к оригинальным описаниям вспышек картофельной болезни в Соединенных Штатах, поскольку они произошли в 1843 – 1845 годах, до того, как это случилось в Европе. Мы искали описания по ключевым словам и, таким образом, смогли воссоздать оригинальные карты вспышек, используя координаты местоположения, упомянутые в документах. Мы также пытались узнать, что люди думали о болезни в то время и откуда она взялась», – говорит Жан Ристайно, заслуженный профессор патологии растений Университета штата Северная Каролина и автор статьи в журнале Scientific Reports, в которой описывается исследование.
Анализ документально подтверждает наличие фитофтороза картофеля в 5 штатах – Нью-Йорке, Делавэре, Массачусетсе, Нью-Джерси и Пенсильвании – до того, как он распространился на остальную часть США и Канаду. Позднее патоген посеял хаос в Европе, особенно в Ирландии.
Авторы статьи также изучили посты в социальных сетях с 2012 по 2022 год, чтобы узнать больше о современном распространении фитофторы. Были проанализированы сообщения на предмет общих и научных названий патогена и определения геолокации источников болезни.
«Анализ социальных сетей был интересен тем, что мы обнаружили, что большинство людей, говорящих об этом заболевании, – ученые из развитых стран, продвигающие свои собственные работы. Также было интересно отметить, что в штатах, где болезнь появилась много лет назад, она есть и сейчас», – говорит Ристайно.
В исследовании также использовались поисковые запросы, что позволило сделать неожиданный вывод. Ученые увидели всплеск количества сообщений о болезни картофеля в 1950-х годах. Проанализировав соответствующую научную литературу, Ристайно обнаружил свидетельства крупной вспышки фитофторы томатов в США после Второй мировой войны.
«Это могло быть появлением нового североамериканского штамма патогена, известного как U.S.1, который стал действительно широко распространен после этого», – говорит Ристайно. Ученые добавили, что планируют продолжить работу и распространить аналитические инструменты на другие болезни и вредителей растений.
[Фото: Jean Ristaino, NC State University]