Открытие нового метода анализа геномов показало присутствие следов неандертальской ДНК в генофонде коренных народов Африки».
Геном современных жителей Африки содержит значительно больше участков ДНК неандертальцев, чем предполагалось ранее. Наши предки взаимодействовали с ними и эпизодически скрещивались, покинув Африку и оказавшись на Евразийском континенте в период от 50 до 80 тысяч лет назад. Более поздние волны миграции из Евразии привнесли некоторые гены неандертальцев и на Африканский континент. К такому заключению пришли авторы новой статьи, опубликованной в журнале Cell.
Неандертальцы являлись ближайшими родственниками человека разумного (H. sapiens) и обитали в Европе и Азии задолго до того, как на эти территории пришли наши предки – начиная с 800 тысяч лет назад. Они вымерли около 40 тысяч лет назад, но успели вступить в контакт с миграционной волной сапиенсов, поэтому ДНК современных людей, живущих за пределами Африки, содержит 1,5-2 процента неандертальской генетической информации. Ранее полагалось, что только жители Африки к югу от Сахары сохранили «чисто» сапиентовскую ДНК. Однако и у современных африканцев обнаруживаются признаки смешения – около 0,5 процента неандертальской ДНК.
Ранее для выявления фрагментов неандертальской ДНК в геноме современных людей их сопоставляли с другими геномами, а также с ДНК современных африканцев, таких как йоруба из Нигерии, используя их в качестве контрольной группы. Предполагалось, что эти популяции не имели контактов с неандертальцами и, следовательно, не содержат их генетического материала. Однако если это предположение неверно, то подобное сравнение неизбежно приводило к искажению результатов анализа.
Джошуа Эки (Joshua Akey), генетик из Принстонского университета, вместе с соавторами разработал новый способ статистического анализа геномов для устранения данного искажения IBDmix, данный метод не предполагает наличие «референсной» популяции. Для проведения исследования ученые собрали образцы ДНК 2,5 тысячи жителей Африки, Европы и Дальнего Востока и сравнили их с уже имеющимися данными о геномах неандертальцев, останки которых были обнаружены в Южной Европе и Сибири.
В ходе исследования генофонда африканцев было выявлено примерно 0,5% неандертальской ДНК. Более 94% этих фрагментов также присутствуют в геноме жителей Евразии, что свидетельствует об их происхождении не напрямую от неандертальцев, а от евразийцев. Эти гены влияют на функционирование иммунной системы и защиту от ультрафиолетового излучения, что объясняет их быструю адаптацию и распространение в Африке.
Новый, усовершенствованный метод анализа позволил выявить и более интересные детали человеческого генома и истории его развития. Например, ученые установили, что часть неандертальской ДНК, присутствующая у современного человека, была передана ему от более ранней волны сапиенсов, покинувших Африку в период между 150 и 100 тысяч лет назад. В дальнейшем, в процессе обратных миграций в Африку, начавшихся примерно 20 тысяч лет назад, некоторые из этих фрагментов вновь оказались в геноме наших предков.
В сумме же в современных европейских популяциях IBDmix насчитал 1,7 процента неандертальской ДНК, в дальневосточных — 1,8 процента. Небольшое количество неандертальского генома, оказавшееся затем снова в Африке, заметно ближе к той части, что сохранилась у европейцев. Это указывает, что именно от них африканцы не так давно получили ДНК наших общих вымерших родственников.