Британские ученые получили образцы дезоксирибонуклеиновой кислоты из двух общественных туалетов средневекового периода, расположенных в Европе и на Ближнем Востоке. Полученные данные, по мнению исследователей, позволят прояснить эволюцию человеческого микробиома и, возможно, выявить факторы, лежащие в основе ряда современных заболеваний.
Исследование опубликовано в журнале Philosophical Transactions of the Royal Society B. Микробиом, представляющий собой совокупность всех микроорганизмов, обитающих в организме человека, у людей, проживающих в индустриальных поселениях, имеет отличия от микробиома сообществ охотников-собирателей.
Ученые полагают, что изменения в микробиоме могут быть причиной многих заболеваний, распространенных в современном индустриальном обществе, таких как аллергии и ожирение. В связи с этим возникла концепция сравнения микробиома людей, живших до индустриальной эпохи, считающегося «здоровым», с современным, который часто характеризуется как «нездоровый.
Содержание было проанализировано учеными из Кембриджского университета средневековых уборных XIV и XV веков (в Иерусалиме и Риге), чтобы выяснить состав содержимого кишечника человека того времени: то есть до появления антибиотиков, фастфуда и других составляющих современного индустриального общества.
Ранее уже проводились схожие исследования, в ходе которых, например, определялась распространенность гельминтозных инвазий у населения Средневековья. Однако, если обнаружение яиц паразитов под микроскопом возможно, то многие кишечные микроорганизмы слишком малы для визуализации. Единственный способ их изучения — восстановление и анализ их ДНК.
Сначала эксперты отнеслись с недоверием к изучению содержимого заброшенных средневековых туалетов, поскольку значительное время, прошедшее с момента их использования, могло привести к разрушению биосигнатур. Как правило, для анализа извлекают бактерии из более долговечных останков, таких как зубы или кости. Важной задачей стало разграничение между обычными почвенными бактериями и теми, что когда-то находились в кишечнике человека.
В результате исследования ученые смогли определить разнообразный состав микроорганизмов, включающий бактерии, археи, грибки и простейшие, населявшие кишечник. Было установлено, что микробиомы, взятые из Иерусалима и Риги, обладали определенными общими чертами характеристики. Эти образцы демонстрировали одновременно сходство с микробиомами современных охотников-собирателей и микробиомами людей, живущих в условиях индустриального общества.
В результате, это формирует самобытную и неповторимую группу, не имеющую параллелей в современной действительности. Ученые отмечают, что для более детального изучения эволюции микробиома в различных популяциях на протяжении времени требуются дополнительные исследования на других археологических памятниках и в разные периоды времени.