Исследователи из Франции выяснили, как бактерия Коха оказала влияние на человеческий геном на протяжении последних двух тысяч лет.
Работа опубликована в American Journal of Human Genetics. На протяжении сотен и тысяч лет человечество столкнулось не только с изменениями климата, но и с различными пандемиями, такими как туберкулез, чума и испанский грипп. Туберкулез, являющийся результатом Mycobacterium tuberculosis, остается одной из ведущих причин смертей, вызванных инфекционными заболеваниями, во всем мире (ежегодно более 1,5 миллиона человек умирают от него, согласно данным ВОЗ).
Считается, что эта инфекция входит в число наиболее опасных за всю историю человечества — более миллиарда человек погибли от нее за последние две тысячи лет. Однако характер и темпы воздействия палочки Коха на нас остаются неизвестными. Ученые из Института Пастера и Парижского университета (Франция) проанализировали данные популяционной генетики, чтобы понять, как естественный отбор повлиял на ее формирование.
Новейшие научные работы продемонстрировали, что вариант гена TYK2, обозначенный как P1104A, ассоциирован с увеличенным риском развития болезни после инфицирования возбудителем туберкулеза. На основе обширной базы данных, включающей более тысячи европейских геномов древнего человека, исследования показали, что вариант Р1104А впервые возник более 30 тысяч лет назад, развившись от предков, живших на территории Западной Евразии.
По мере углубления анализа было установлено, что частота этого варианта значительно уменьшилась примерно две тысячи лет назад. Это совпадает с периодом формирования современных штаммов Mycobacterium tuberculosis стали преобладать. Авторы исследования выяснили, что в бронзовом веке вариант гена P1104A был более распространенным, чем в наши дни. И, вероятно, это было связано с повышенной заболеваемостью туберкулезом у людей того времени.
Частота аллеля P1104A демонстрировала значительные изменения в Европе в течение последних десяти тысяч лет, начиная с миграций анатолийских неолитических фермеров и евразийских степных жителей. Однако примерно две тысячи лет назад произошел интенсивный процесс отрицательного отбора, который привел к уменьшению распространенности данного варианта гена на 20 процентов, что является одним из наиболее выраженных примеров подобного воздействия на геном человека.